Ксантомонадная инфекция и озоновый стресс заметно влияют на структуру и взаимодействие микробного сообщества в филлосфере перца.

Новости

ДомДом / Новости / Ксантомонадная инфекция и озоновый стресс заметно влияют на структуру и взаимодействие микробного сообщества в филлосфере перца.

Dec 02, 2023

Ксантомонадная инфекция и озоновый стресс заметно влияют на структуру и взаимодействие микробного сообщества в филлосфере перца.

ISME Communications, том 3,

ISME Communications, том 3, номер статьи: 24 (2023 г.) Цитировать эту статью

Доступы 1985 г.

12 Альтметрика

Подробности о метриках

Хотя физиологический и транскрипционный ответ хозяина на биотические и абиотические стрессы интенсивно изучаются, мало что известно об устойчивости связанных микробиомов и их вкладе в толерантность или реакцию на эти стрессы. Мы оценили влияние повышенного тропосферного озона (O3) индивидуально и в сочетании с инфекцией Xanthomonas perforans в полевых условиях камеры с открытым верхом на общий исход заболевания у устойчивых и восприимчивых сортов перца, а также связанную с ними структуру микробиома, функции и сеть взаимодействия. протяжении вегетационного периода. Заражение патогеном привело к появлению четкой структуры и функций микробного сообщества на восприимчивом сорте, в то время как одновременный стресс O3 не привел к дальнейшему изменению структуры и функций сообщества. Однако стресс O3 усугубил тяжесть заболевания у устойчивых сортов. Это изменение тяжести заболевания сопровождалось повышенной гетерогенностью связанной популяции Xanthomonas, хотя существенных изменений в общей плотности микробиоты, структуре микробного сообщества и функциях не наблюдалось. Сети совместного возникновения микробов при одновременном стрессе O3 и воздействии патогенов указывают на сдвиг наиболее влиятельных таксонов и менее связанной сети, что может отражать изменение стабильности взаимодействий между членами сообщества. Повышенная тяжесть заболевания у устойчивых сортов может быть объяснена такой измененной сетью совместной встречаемости микробов, что указывает на измененную связанную с микробиомом профилактическую защиту от патогенов при повышенном уровне O3. Наши результаты показывают, что микробные сообщества отчетливо реагируют на отдельные и одновременные стрессоры, в данном случае на стресс O3 и патогенную инфекцию, и могут играть значительную роль в прогнозировании того, как изменятся взаимодействия растений и патогенов в условиях изменения климата.

Филлосфера (надземная часть) растений представляет собой уникальную, бедную питательными веществами среду обитания и населена различными прокариотическими и эукариотическими микроорганизмами [1], колонизирующими либо поверхность листа (эпифиты), либо внутри ткани листа (эндофиты) [2, 3]. . На сборку и последовательность микробного сообщества листьев влияют детерминированные и стохастические процессы. Хотя расселение от соседних растений и другие демографические факторы, такие как идентичность соседей и возраст, являются факторами, способствующими разнообразию микробиома филлосферы [4], факторы растения-хозяина, такие как генотип хозяина, стадия развития [5] и устойчивость хозяина [6], формируют сборку микробиома. . Такая фильтрация микробиома хозяина наблюдается из-за разной доступности ресурсов на поверхности листьев [7], разных физических свойств [8] и передачи защитных сигналов хозяина [9, 10].

Известно, что члены микробиома филлосферы играют роль в усвоении питательных веществ [11], росте и продуктивности растений [12], а также в устойчивости к различным биотическим и абиотическим стрессам [13,14,15,16,17]. Инвазия патогенов является одним из наиболее влиятельных биотических стрессов, влияющих на микробный комплекс растений в филлосфере [18]. Патогены могут изменять среду обитания путем секреции факторов вирулентности, биосурфактантов или гормонов, тем самым увеличивая доступность ресурсов для процветания других местных колонизаторов, включая оппортунистов [19, 20]. Патогены также могут влиять на резидентную микрофлору через нишу или конкуренцию за ресурсы [1, 18, 19, 21]. Защитная сигнализация растений, активируемая в ответ на атаку патогенов, также была указана как источник изменения филлосферного сообщества [16, 22]. Независимо от источника изменений в сообществе филлосферы, считается, что доминирующие члены восстанавливают стабильность этого нарушенного сообщества [23]. Кроме того, появляется все больше данных, свидетельствующих о том, что растения могут рекрутировать микробы в филлосфере, которые обеспечивают защиту от патогена [24,25,26], что указывает на сборку подавляющего болезнь микробиома в филлосфере в ответ на патоген, аналогичную тому, что наблюдалось в ризосфере [24,25,26]. 27, 28]. Структура и состав микробного сообщества филлосферы также формируется реакцией растения-хозяина на абиотические стрессы, такие как засуха [29, 30], повышение приземной температуры или потепление [31,32,33], повышенный уровень CO2 [34] и ультрафиолетовое излучение [34]. 35].

2.5 were classified as significantly increased within one of the two groups./p> 0.05) (Table S10A, B). However, the interaction between inoculation, cultivar, and sampling time had a significant effect on microbial functions and gene families (p < 0.01) (Table S10A, B), as indicated by dissimilarities in the functional composition of both gene families and pathways associated with communities recovered from the inoculated susceptible cultivar compared to the inoculated resistant cultivar. We observed significant effect of cultivar during the end of the season (p = 0.01) (Table S10C). Elevated O3 did not alter the functional assemblage of phyllosphere microbiome either on resistant or susceptible cultivars and regardless of the inoculation status. We observed similar functional profiles both in terms of genes as well as pathways across timepoints during the growing season on the respective cultivars despite differences in the species composition in mid vs. end of the season samples. This is likely due to substantial functional redundancy in the metabolic pathways associated with microbial communities over the growing season despite seasonal succession of taxa in the phyllosphere./p>